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《細(xì)胞》:免疫治療獲重大進(jìn)展!科學(xué)家證實(shí),腫瘤中癌細(xì)胞的異質(zhì)性,或是免疫治療成敗的決定性因素

發(fā)布日期:2019-10-22

近日,癌癥免疫治療領(lǐng)域又取得突破性進(jìn)展。

來自以色列魏茨曼科學(xué)研究院的Yardena Samuels與美國國家癌癥研究所的Eytan Ruppin聯(lián)合團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),在黑色素瘤中,腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(ITH)越高,免疫系統(tǒng)抗癌的能力就越容易被抑制,癌癥進(jìn)展的就更快。

而且,他們還發(fā)現(xiàn),在黑色素瘤中,相比于腫瘤突變負(fù)荷(TMB)等因素,腫瘤內(nèi)異質(zhì)性對(duì)免疫治療的效果影響更大。甚至腫瘤內(nèi)異質(zhì)性對(duì)免疫治療療效的預(yù)測(cè),比TMB更好。這項(xiàng)重要的研究成果發(fā)表在頂級(jí)期刊《細(xì)胞》上[1]。

▲ 腫瘤異質(zhì)性與免疫響應(yīng)和患者生存之間的關(guān)系

說起腫瘤免疫治療,我們都知道,在腫瘤免疫治療領(lǐng)域有個(gè)非常重要的假設(shè):腫瘤的突變負(fù)擔(dān),也就是TMB越大,新抗原就越多,腫瘤的免疫原性就越強(qiáng)[2,3]。

言外之意,TMB越高,免疫治療效果應(yīng)當(dāng)更好。

近年來的一些研究也確實(shí)證實(shí),TMB高與免疫檢查點(diǎn)抑制劑治療效果好相關(guān)[2-6]。去年,全球首個(gè)期前瞻性臨床研究表明,TMB可以作為免疫治療療效的預(yù)測(cè)方法[7]。

不過,與此同時(shí),很多科學(xué)家也觀察到,TMB高的患者對(duì)免疫治療的反應(yīng)也不一致[8],很多TMB低的患者對(duì)免疫治療也有反應(yīng)[9]

這就讓很多科學(xué)家對(duì)TMB與免疫治療之間的關(guān)系起了疑心,恐怕不靠譜啊,背后肯定還有其他的重要因素沒有被逮到。


▲ 免疫細(xì)胞(該圖片由David MarkPixabay上發(fā)布)

那么這個(gè)躲藏在幕后操縱一切的無形之手究竟是啥呢?

思路得從科研論文里面找。

SamuelsRuppin團(tuán)隊(duì)的研究人員注意到,最近有些研究發(fā)現(xiàn)腫瘤內(nèi)的異質(zhì)性(ITH)可能會(huì)影響免疫系統(tǒng)對(duì)它監(jiān)視[10-12]。

腫瘤內(nèi)的異質(zhì)性是啥意思呢?實(shí)際上,腫瘤細(xì)胞在分裂增殖的過程中,它們的后代在基因上會(huì)與前面的腫瘤細(xì)胞出現(xiàn)差異,這就是腫瘤的進(jìn)化,是腫瘤細(xì)胞的之間的遺傳多樣性。

有些讀者可能要問了,那這和TMB有啥區(qū)別?雖然TMB和腫瘤的異質(zhì)性你中有我,我中有你,但是還真有區(qū)別。例如,TMB很高的腫瘤異質(zhì)性可能很低;而一個(gè)異質(zhì)性很高的腫瘤也可以有很低TMB。這是為啥呢?

舉個(gè)極端的例子,如果一個(gè)腫瘤里面的所有細(xì)胞都是同一個(gè)細(xì)胞的翻版,那無論這個(gè)腫瘤細(xì)胞里面有多少突變,它們都是一毛一樣的。這個(gè)腫瘤可以說就沒有異質(zhì)性了,哪怕它的TMB大破天。反之亦然。當(dāng)然這種現(xiàn)象在臨床上是不存在的。

▲ 左圖異質(zhì)性高,右圖異質(zhì)性低

實(shí)際上,已經(jīng)有一些研究觀察到了腫瘤內(nèi)異質(zhì)性低與患者預(yù)后好之間存在相關(guān)性[13,14]。這就意味著腫瘤的異質(zhì)性與腫瘤的免疫監(jiān)視高度相關(guān),確實(shí)值得研究。

研究人員首先在現(xiàn)有的TCGA數(shù)據(jù)庫中做了初步分析。他們發(fā)現(xiàn),對(duì)于黑色素瘤患者而言,患者的TMB和基因的拷貝數(shù)變異,作為單一預(yù)測(cè)因子,與患者的生存率沒有相關(guān)性。但是腫瘤異質(zhì)性低的患者,生存期明顯好于異質(zhì)性高的。這也與之前的研究結(jié)果一致。

進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),異質(zhì)性高且TMB或拷貝數(shù)變異低的患者,生存率最差??刂茲撛诘幕祀s因素之后,這個(gè)結(jié)果仍然成立。

這些結(jié)果清晰地告訴研究人員,腫瘤的異質(zhì)性對(duì)患者的生存影響非常大。真的值得單獨(dú)研究。

▲ 各種不同的因素與患者生存率之間的關(guān)系

不過,擺在研究人員面前的一個(gè)問題是,盡管TMB與異質(zhì)性存在不同,但是正如我們前面說過的那樣,它們二者大部分時(shí)候是你中有我,我中有你,要單獨(dú)拆開來研究是非常不容易的。

本研究的創(chuàng)新之處在此時(shí)就迸發(fā)出來了。

研究人員用適度的紫外線(UVB)照射一個(gè)黑色素瘤細(xì)胞系,照完之后做全外顯子測(cè)序。結(jié)果和預(yù)料的一樣,照射后的黑色素瘤細(xì)胞的TMB升高了,異質(zhì)性也升高了。不過,經(jīng)過紫外線照射的細(xì)胞在培養(yǎng)皿里的生長(zhǎng)速度卻變慢了。

▲ 細(xì)胞系被UVB處理過程

然后他們將未經(jīng)紫外線照射,和紫外線照射處理的癌細(xì)胞,分別移植到不同的小鼠體內(nèi)。結(jié)果發(fā)現(xiàn)經(jīng)過紫外線照射的癌細(xì)胞,在小鼠體內(nèi)形成的腫瘤,生長(zhǎng)速度卻是明顯變快了。這暗示,紫外線照射后的癌細(xì)胞,對(duì)免疫系統(tǒng)的抑制似乎變得更強(qiáng)了。

UVB照射后,癌細(xì)胞變得狂野了

隨后,研究人員用PD-1抑制劑分別處理兩組小鼠,結(jié)果正如研究人員預(yù)期的那樣:經(jīng)過紫外線照射的癌細(xì)胞,對(duì)PD-1抑制劑的反應(yīng)小。這進(jìn)一步暗示,腫瘤的異質(zhì)性在背后搗鬼。

眼尖的朋友肯定已經(jīng)注意到了,上面的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)并沒有將TMB撇開。

為了解決這個(gè)問題,研究人員做了一個(gè)巧妙的設(shè)計(jì)。

他們從經(jīng)過紫外線處理的黑色素瘤細(xì)胞中,單獨(dú)分離出來了兩個(gè)單細(xì)胞克?。?/span>SCC)。單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果發(fā)現(xiàn),這兩個(gè)單細(xì)胞克隆的異質(zhì)性非常低,細(xì)胞的突變量差異也非常大,從360016977個(gè)體細(xì)胞突變的細(xì)胞都有。

然后把這兩個(gè)單細(xì)胞克隆和它們的親代細(xì)胞分別移植到不同的小鼠身上,結(jié)果出人意料。異質(zhì)性極低的單細(xì)胞克隆丟失了親代的攻擊性表型,變得特別不愛生長(zhǎng)。

▲ 和爹媽相比,單克隆(SCC)似乎都不太行

為了進(jìn)一步確認(rèn),研究人員又分離了20個(gè)單細(xì)胞克隆,和上面的結(jié)果一致,長(zhǎng)出的腫瘤非常小,一般在2-3周左右就自行消失了。這基本就確定異質(zhì)性低與腫瘤攻擊性低有關(guān)。

▲ 所有的單克隆都不行

在后面的研究中,研究人員還將上面的20個(gè)克隆分組混合移植給小鼠,發(fā)現(xiàn)混合的越多,異質(zhì)性越高,腫瘤的生長(zhǎng)速度越快。即使是在突變負(fù)荷相似的條件下,這個(gè)結(jié)論仍然成立。這就證實(shí):腫瘤內(nèi)異質(zhì)性決定了腫瘤的增長(zhǎng)。

▲ 混合研究實(shí)驗(yàn)

那背后的原因又是什么呢?

研究人員發(fā)現(xiàn),異質(zhì)性低更容易被免疫系統(tǒng)排斥。如果敲除小鼠體內(nèi)的T細(xì)胞,它們就可以和爸爸媽媽們一樣放肆生長(zhǎng)了。

▲ 沒有了免疫系統(tǒng)的壓制,單克隆活了

說來也奇怪,對(duì)于那些單克隆癌細(xì)胞形成的腫瘤而言,T細(xì)胞浸潤更多,而且T細(xì)胞也更活躍,甚至連有免疫抑制功能的調(diào)節(jié)T細(xì)胞都變少了。

研究人員認(rèn)為,相比于異質(zhì)性低的腫瘤而言,異質(zhì)性高的腫瘤由于新抗原被“被稀釋”,就變得沒有免疫原性。

最后,研究者們分析了經(jīng)過PD-1抑制劑或CTLA-4抑制劑體治療的患者生存率,發(fā)現(xiàn)患者生存率與腫瘤的異質(zhì)性密切顯著相關(guān),而TMB沒有顯著相關(guān)性。

總的來說,這個(gè)研究表明,腫瘤的異質(zhì)性是個(gè)很好的預(yù)測(cè)黑色素瘤療效的標(biāo)志物,而且可以與TMB聯(lián)合使用。

參考資料:

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[3].Hellmann, M. D., Nathanson, T., Rizvi,H., Creelan, B. C., Sanchez-Vega, F., Ahuja, A., ... & Liu, C. (2018).Genomic features of response to combination immunotherapy in patients withadvanced non-small-cell lung cancer. Cancer Cell, 33(5), 843-852.

[4].Chan, T. A., Yarchoan, M., Jaffee, E.,Swanton, C., Quezada, S. A., Stenzinger, A., & Peters, S. (2018).Development of tumor mutation burden as an immunotherapy biomarker: utility forthe oncology clinic. Annals of Oncology, 30(1), 44-56.

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[7].Hellmann, M. D., Ciuleanu, T. E.,Pluzanski, A., Lee, J. S., Otterson, G. A., Audigier-Valette, C., ... &Borghaei, H. (2018). Nivolumab plus ipilimumab in lung cancer with a high tumormutational burden. New England Journal of Medicine, 378(22), 2093-2104.

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[11].McGranahan, N., Furness, A. J.,Rosenthal, R., Ramskov, S., Lyngaa, R., Saini, S. K., ... & Watkins, T. B.(2016). Clonal neoantigens elicit T cell immunoreactivity and sensitivity toimmune checkpoint blockade. Science, 351(6280), 1463-1469.

[12].Rosenthal, R., Cadieux, E. L.,Salgado, R., Al Bakir, M., Moore, D. A., Hiley, C. T., ... & Henry, J. Y.(2019). Neoantigen-directed immune escape in lung cancer evolution. Nature,567(7749), 479.

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[14].Miao, D., Margolis, C. A., Vokes, N.I., Liu, D., Taylor-Weiner, A., Wankowicz, S. M., ... & Manos, M. (2018).Genomic correlates of response to immune checkpoint blockade inmicrosatellite-stable solid tumors. Nature genetics, 50(9), 1271.

(來源于: 奇點(diǎn)糕 奇點(diǎn)網(wǎng))

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